مدرسه با تلفیقی از برنامه رسمی وزارت آموزش و پرورش و برنامه‌های تکمیلی و نوآورانه مدارس سلام، یک سیستم آموزشی مفهوم‌محور، مهارت‌بنیان و دانش‌آموزمحور را اجرا می‌کند. تأکید اصلی بر یادگیری عمیق، تقویت تفکر نقاد و پرورش توانایی حل مسئله است.

هدف اصلی، یادگیری پایدار است. ارزشیابی به صورت ترکیعی (تکالیف هدفمند، پروژه‌ها، مشارکت کلاسی و آزمون‌های دوره‌ای) انجام می‌شود. مشق شب معمولاً هدفمند و در چارچوب مشخص است تا علاوه بر تثبیت یادگیری، زمان مناسبی برای استراحت و فعالیت‌های فردی دانش‌آموز باقی بماند.

برنامه‌های متنوعی از جمله کارگاه‌های مهارت‌های زندگی، فعالیت‌های گروهی و پروژه‌محور، اردوهای آموزشی-تفریحی، برگزاری مسابقات و جشنواره‌های درون‌مدرسه‌ای، و تشکیل شوراهای دانش‌آموزی برای رشد اجتماعی، اعتمادبه‌نفس، کار تیمی و مسئولیت‌پذیری طراحی شده است.

با پیگیری سیستم نظارت و پایش مداوم، این دانش‌آموزان شناسایی شده و از طریق برنامه‌های کمکی درسی (جبرانی-تقویتی)، مشاوره تحصیلی و تربیتی فردی، و طراحی برنامه حمایتی اختصاصی با همراهی خانواده، از آن‌ها پشتیبانی می‌شود.

باشگاه‌های متنوعی مانند روباتیک، نجوم، ادبی، تئاتر، هنرهای تجسمی، سرود، ورزش‌های تخصصی (والیبال، فوتبال و…)، و کلاس‌های تقویت زبان بر اساس علاقه و استعداد دانش‌آموزان ارائه می‌شود.